A Ecossistema possui ampla experiência em estudos de levantamento de fauna, como mamíferos, répteis, anfíbios, aves, peixes e invertebrados. Os estudos de levantamento de fauna têm como objetivo avaliar a distribuição das espécies, riqueza, abundância, diversidade, presença de espécies ameaçadas de extinção, endemismos e na identificação das principais ameaças e medidas mitigadoras.

A empresa realiza também estudos de monitoramento de fauna objetivando avaliar possíveis impactos nas comunidades e nas populações de diversos táxons em decorrência da implantação e operação de empreendimentos. Dentre as técnicas utilizadas nesses estudos estão: marcação e recaptura, telemetria, morfometria e estudos moleculares para avaliar o fluxo gênico entre populações e a ocorrência de espécies crípticas.